Zones humides, espèces protégées, eau potable : ce que le chantier menace

Entre Machilly et Thonon, le tracé franchit une quarantaine de cours d’eau (selon France Nature Environnement Haute-Savoie), des bois humides, des prairies à sources et les abords du captage d’eau potable du Bois d’Anthy. Deux autorités publiques ont rendu en 2026 des avis sévères sur ces atteintes.

Un avis défavorable du CNPN

Le 26 février 2026, le Conseil national de la protection de la nature (commission espèces et communautés biologiques) a rendu un avis défavorable sur la dérogation qui autorise à détruire des espèces protégées et leurs habitats. Il conteste que le projet réponde à une « raison impérative d’intérêt public majeur », condition exigée par la loi. Il juge insuffisantes les mesures prévues pour éviter, réduire et compenser les atteintes, et relève que des fouilles archéologiques et des sondages géotechniques ont eu lieu sans dérogation, ce qui constitue selon lui « une irrégularité » (p. 17). Le dossier d’AMEDEA calcule une dette écologique de 156,4 ha et 2,84 km de haies, et prévoit 328 ha à compenser, dont 145 ha de zones humides. Pour le CNPN, ce calcul « repose sur des impacts résiduels sous-estimés » : il faudrait donc compenser davantage. Cet avis n’est que consultatif, et le préfet a signé l’autorisation malgré lui.

L’eau potable du Bois d’Anthy

Le tracé traverse les périmètres de protection rapprochée et éloignée du captage du Bois d’Anthy, qui alimente en eau potable Anthy-sur-Léman (réseau géré par Thonon Agglomération). Pour l’Autorité environnementale, c’est le tronçon « le plus critique » du projet (p. 39) : « risque de pollution chronique et accidentelle, possibilité de perte d’alimentation par imperméabilisation ». Dans le vallon des Eply, précise-t-elle, « la nappe n’est pas protégée par une couverture argileuse ». En creusant la chaussée en tranchée, on réduira encore cette couche protectrice.

Sur la carte ci-dessous, les périmètres de protection du captage sont reportés en bleu à partir du plan de l’arrêté (à 50 m près). D’après ce report, l’axe publié de l’autoroute traverse le périmètre rapproché sur environ 550 m et le périmètre éloigné sur environ 850 m (calcul A412.info).

L’Autorité environnementale conclut : « du fait de ces risques cette zone doit être évitée ou à défaut un éloignement plus important par rapport au captage et aux secteurs les plus sensibles doit être recherché » (p. 40). Le projet n’a pas été déplacé. Il prévoit des fossés étanches, des bassins à fond étanche et un suivi de la qualité de l’eau pendant cinq ans.

Ce captage a déjà été touché par un chantier routier. L’étude hydrogéologique jointe au dossier de protection du captage rapporte que les travaux du contournement de Thonon ont « mis en évidence la très forte vulnérabilité du captage » : un forage a provoqué un jaillissement de 80 m³ d’eau par heure et « un tarissement temporaire du captage ». La même étude demande, pour tout projet routier sur ce tracé, de protéger « cet aquifère patrimonial », en rendant étanches les zones de déblais et avec un « assainissement routier de la plateforme parfaitement étanche ». Elle note aussi que le débit de la source baisse nettement en été.

Les collectivités veulent en outre produire davantage d’eau à ce captage et élargir son périmètre de protection (FNE et Autorité environnementale) : une enquête publique s’est tenue du 18 mai au 20 juin 2026. Le préfet a signé l’arrêté qui fixe les nouveaux périmètres de protection le 28 août 2026, le même jour que l’autorisation de l’autoroute.

Voir le projet en grand

Pourquoi les zones humides comptent

Selon l’Office français de la biodiversité, le sol des milieux humides « absorbe comme une éponge les afflux d’eau et les relâche progressivement ». Les marais, les prairies humides, les sources et les bords de ruisseaux retiennent l’eau des pluies et des crues, la filtrent, rechargent les nappes et la rendent lentement aux cours d’eau, ce qui aide à passer les périodes sèches. L’Autorité environnementale le rappelle pour les zones humides alluviales du tracé : elles « jouent un rôle clé dans la régulation des crues, la recharge des nappes, l’épuration naturelle de l’eau, le soutien au débit d’étiage » (le débit des rivières en période sèche).

Ce soutien en été se mesure à l’échelle d’un bassin versant, où une seule zone humide pèse peu. Chaque zone détruite retire pourtant un peu de cette réserve, dans un Chablais où l’eau a manqué l’été, en 2022 comme en 2026. La Confédération paysanne de Haute-Savoie rappelle que, parmi les zones humides que le projet va assécher, il y a « de nombreuses prairies, parmi les milieux les plus résistants aux sécheresses et les plus riches en biodiversité » (Librinfo74, 3 septembre 2026).

Les espèces protégées : qui vit là

L’Autorité environnementale relève un enjeu fort pour les oiseaux (110 espèces, dont 90 nicheuses), les amphibiens (dix espèces, toutes protégées), les chauves-souris (24 espèces, toutes protégées) et plusieurs plantes rares. Voici quelques-unes des espèces citées. Les photos sont des illustrations prises ailleurs ; pour chaque espèce, nous disons qui la cite.

Nous ne publions pas l’emplacement des terriers, des huttes, des mares et des stations de plantes : sur la carte de l’observatoire, les zones de présence sont volontairement approximatives. Le castor d’Europe est une espèce protégée, présente dans le secteur ; il n’est pas endémique : il vit dans une grande partie de l’Europe (Office français de la biodiversité).

iPhoto d’un militant, transmise à A412.info

Ce que dénonce France Nature Environnement Haute-Savoie

Dans son analyse du dossier (8 juin 2026), FNE Haute-Savoie relève aussi les atteintes suivantes :

• Des zones humides sous-évaluées : « pas moins de 56 hectares de zones humides qui seraient détruits par les travaux, un chiffre probablement sous-évalué au vu des lacunes de l’état initial », sans compter les impacts indirects sur les milieux voisins. L’Autorité environnementale relève elle aussi que des sondages « n’ont pas pu être réalisés dans certains secteurs aux sols fortement tassés ou érodés », « sans indication de leur ampleur » (p. 45).
• Des cours d’eau fragilisés : le tracé franchit une quarantaine de cours d’eau et modifie le profil de 13 d’entre eux. Pendant les travaux, des pompages puiseront dans la nappe, et un forage proche de Machilly « devrait assécher une zone humide ». Les débits d’étiage retenus par l’étude d’impact « semblent surévalués et irréalistes », ce qui permettrait des prélèvements nuisibles à la vie aquatique. Le ruisseau de la Gurnaz, « réservoir biologique essentiel », serait franchi par trois ouvrages successifs. L’Autorité environnementale relève elle aussi que les services de l’État « signalent des erreurs sur l’identification des débits d’étiage, en particulier sur le Foron de Sciez » (p. 36). Elle rappelle que la Gurnaz est classée réservoir écologique dans le Sdage, le plan de gestion des eaux du bassin Rhône-Méditerranée, et demande « une attention particulière » pour ses trois ouvrages (p. 37).
• Des espèces protégées : le projet détruirait des habitats de reproduction du bruant des roseaux et toucherait le chat forestier et le castor d’Europe. Le risque de collision des oiseaux avec les véhicules est « occulté » par l’étude d’impact, pour les rapaces de nuit et de jour comme pour le martin-pêcheur d’Europe. Pour FNE, « les conditions cumulatives requises pour l’octroi d’une dérogation pour la destruction d’espèces protégées ne sont pas remplies ».

À lire aussi : Vivre à côté : bruit, air, chemins coupés · Prairies, fermes et reblochon : ce que le tracé prend à l’agriculture

Forêt, prairie, bitume : la chaleur

Remplacer une forêt par du bitume change la température au sol. On confond souvent deux mesures :

• la température de surface, celle du sol, de la chaussée ou du feuillage, mesurée par thermomètre infrarouge ou par satellite ;
• la température de l’air, celle que l’on ressent et que mesurent les stations météo, à deux mètres du sol.

Les études publiées donnent ces résultats.

Pour l’A412, on peut dire ceci : le projet remplace environ 85 ha de forêts et de fourrés et rend étanches au moins 55 ha de sol. En été, la surface de la chaussée sera bien plus chaude que celle d’une prairie, et surtout que celle d’un sous-bois. Les lisières ouvertes par la coupe exposeront les bois restants à un air plus chaud et plus sec le long de la trouée.

On ne peut pas dire, en revanche, de combien de degrés l’A412 réchauffera le Chablais. Aucune étude ne chiffre l’effet d’une route de 16,5 km sur la température de l’air d’un territoire, et le dossier ne contient aucune étude du climat local. L’effet se concentre sur la chaussée, ses abords et les lisières. Il s’ajoutera au réchauffement attendu d’ici 2050, de l’ordre de 2,3 °C en moyenne annuelle selon l’Autorité environnementale.

Les arbres abattus : ce qu’ils stockaient, ce qu’ils absorbaient

Après

Avant

iContient des données Copernicus Sentinel-2 modifiées (2026), données libres Copernicus

Et si l’on replantait ? Une jeune forêt absorbe peu, car ses arbres sont petits et leur croissance ne décolle qu’au bout de plusieurs décennies. Pour les feuillus, l’Office national des forêts situe le pic d’absorption du carbone vers 50 à 60 ans. Replanter 15, 20 ou 25 hectares ne rendrait donc le service d’une forêt adulte qu’à la génération suivante, et seulement si le sol n’a pas été tassé ou décapé. Sous l’autoroute, rien ne repoussera. Ce que promet AMEDEA pour l’environnement

Un non-sens écologique : ce que fait une forêt

Une forêt stocke du carbone, et elle rend d’autres services :

• elle rafraîchit : sous les arbres, les températures maximales sont en moyenne 4,1 °C plus basses qu’à découvert (moyenne mondiale, De Frenne et al., 2019) ;
• elle filtre l’eau : les eaux forestières contiennent en général moins de 5 milligrammes de nitrates par litre, dix fois moins que la limite de qualité de 50 milligrammes par litre (Centre national de la propriété forestière, 2015), ce qui compte à deux pas du captage du Bois d’Anthy ;
• elle garde les sols vivants : ses feuilles et son bois mort nourrissent le sol et ses organismes, et son ombre y garde l’humidité ;
• elle abrite la faune : dans le monde, les forêts accueillent 80 % des espèces d’amphibiens, 75 % des oiseaux et 68 % des mammifères (Organisation des Nations unies pour l’alimentation et l’agriculture, FAO, 2020).

Notre lecture. Abattre une forêt adulte pour une autoroute est un non-sens écologique : on perd en quelques semaines ce qu’il faudra au moins un demi-siècle pour reconstituer, quand c’est encore possible.

Le bois abattu : récolté, vendu… et broyé ?

Les arbres coupés sont récoltés et vendus. Près de 8 000 m³ de bois doivent être coupés sur le tracé (ICI Pays de Savoie, 1er septembre 2026).

Ce que constate le collectif. Sur le chantier, les troncs sont sortis du bois et chargés. Une entreprise forestière spécialisée, dont l’activité comprend le bois énergie, y a été vue (voir Qui décide, qui réalise ?). Selon ce que le collectif observe et entend sur place, la majeure partie de ce bois partirait au broyage, en plaquettes pour les chaudières, plutôt qu’en bois d’œuvre. Ni le concessionnaire ni l’entreprise n’ont publié la destination des bois, les volumes par usage ou les prix.

Combien vaut ce bois ? Voici un ordre de grandeur, à partir de deux prix publiés et d’une hypothèse du collectif : environ 20 % du volume peut donner du bois d’œuvre (poutres, charpente, planches), le reste du bois de chauffage ou des plaquettes.

Si les beaux bois partent eux aussi au broyeur, environ 100 000 à 130 000 € de valeur sont perdus sur les seuls 1 600 m³ de bois d’œuvre. Ce calcul ne compte ni la valeur ajoutée d’une charpente ou d’un meuble, ni le carbone qu’ils auraient gardé. Les plaquettes forestières sont le produit le moins cher de la filière : 3,3 centimes le kilowattheure livré, contre environ 7 pour les granulés (bilan énergétique de la France, 2023). Ces chiffres ne disent pas ce qu’a touché chaque propriétaire : c’est ce qu’il faut demander.

Pourquoi c’est un gâchis. Scié en planches ou en charpente, un chêne ou un frêne garde son carbone pendant des décennies. Broyé et brûlé, il le rend à l’air en quelques mois, et il se vend au prix le plus bas de la filière : des arbres de plusieurs dizaines d’années finiraient en chauffage d’un hiver.

Et un moindre dédommagement ? Jusqu’à l’expropriation, les arbres appartiennent au propriétaire du terrain, et son indemnité doit comprendre la valeur du bois sur pied. Si ce bois est estimé au prix du broyat plutôt qu’à celui du bois d’œuvre, l’indemnité baisse d’autant, alors que le bois est vendu par d’autres. Aucun document public ne dit aujourd’hui comment les bois ont été estimés dans les offres d’achat.

Le climat

L’Autorité environnementale chiffre les émissions du projet à 286 000 tonnes équivalent CO₂ sur vingt ans, et le juge non conforme à la stratégie nationale bas-carbone. Le détail (chantier, circulation, sols, adaptation) est dans notre dossier Le climat et l’A412 : ce que coûte l’autoroute en CO₂.

Sur le chantier

Les 9 et 10 septembre 2026, l’Association de concertation et de proposition pour l’aménagement et les transports (ACPAT), puis France Nature Environnement (FNE) Haute-Savoie, ont signalé aux services de l’État que des mesures prescrites par l’autorisation n’étaient pas appliquées. Selon FNE, l’écologue qui doit assister aux abattages (mesure MR1) était absent « à plusieurs reprises », et l’association n’observait sur le terrain aucune des mares et ornières de remplacement pour les amphibiens qui devaient être creusées avant les travaux (mesure MR7 : deux mares permanentes, cinq mares temporaires et douze ornières).

Le 2 octobre, FNE affirmait que plusieurs mesures censées protéger les amphibiens (sonneurs à ventre jaune, grenouilles rousses, grenouilles agiles, salamandre) « ne sont pas respectées », et estimait que plus de 30 hectares de forêt avaient déjà été abattus sur les 76 prévus.